Le PNUD en appui au Gouvernement grâce à la contribution de partenaires et fonds globaux tels que le Fond pour l'environnement mondial (FEM) et Le Fonds vert pour le climat, mène des initiatives principalement dans les domaines de la biodiversité notamment des marines protégées, des changements climatiques, de l’énergie, du renforcement des capacités systémiques et institutionnels et aide le gouvernement de Djibouti à accéder au financement disponible, avec un accent.

Ainsi, par le biais de plusieurs projets, le PNUD accompagne le gouvernement de Djibouti à renforcer la résilience climatique et travaille avec les communautés locales et les organisations de la société civile pour améliorer les moyens de subsistance.

Plusieurs projets sont financés par le Fonds pour l'environnement mondial et contribuent à la préservation de la biodiversité marine par l'extension des aires marines protégées et la réduction des pressions sectorielles sur la biodiversité marine et côtière. Le PNUD soutient également le renforcement de la résilience des communautés agricoles rurales et la préservation de l'écosystème terrestre pour atténuer le changement climatique et permettre l'amélioration des moyens de subsistance par l'augmentation de la productivité des communautés agro-pastorales.

Le PNUD travaille en étroite collaboration avec le ministère de l'environnement et le ministère de l'énergie pour promouvoir l'accès à une énergie abordable pour les personnes vivant dans des zones extrêmement éloignées, grâce à l'installation de mini-réseaux.

Par le biais de programmes de petites subventions ou micro Grant (SGP), le PNUD fournit un soutien financier et technique aux organisations de la société civile locale dans les régions et aux organisations communautaires pour développer et mettre en œuvre des actions locales qui utilisent des solutions locales pour apporter des solutions aux problèmes environnementaux au niveau local tout en contribuant à résoudre les problèmes environnementaux mondiaux.