Con el objetivo de evaluar de manera continua y segura la condición del bentos arrecifal de las Áreas Marinas Protegidas (AMP) incluidas en el Proyecto Archipiélagos del Sur de Cuba, se creó el Programa de Monitoreo del Bentos en los Arrecifes de Coral.

En una primera etapa se caracterizaron los arrecifes coralinos representativos dentro de cada AMP, y posteriormente se establecieron estaciones de monitoreo para ser revisadas una vez al año.